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Gene Ontology(GO)分析
作者:admin    發(fā)表時(shí)間:2015-09-23
Gene Ontology(GO)分析

Gene Ontology可分為分子功能(Molecular Function),生物過(guò)程(biological process)和細(xì)胞組成(cellular component)三個(gè)部分。蛋白質(zhì)或者基因可以通過(guò)ID對(duì)應(yīng)或者序列注釋的方法找到與之對(duì)應(yīng)的GO號(hào),而GO號(hào)可對(duì)于到Term,即功能類別或者細(xì)胞定位。

參考網(wǎng)站:http://www.geneontology.org

 

功能分類

GO功能分類是在某一功能層次上統(tǒng)計(jì)蛋白或者基因的數(shù)目或組成,往往是在GO的第二層次。此外也有研究都挑選一些Term,而后統(tǒng)計(jì)直接對(duì)應(yīng)到該Term的基因或蛋白數(shù)。結(jié)果一般以柱狀圖或者餅圖表示.

 

 

功能富集分析

功能富集需要有一個(gè)參考數(shù)據(jù)集,通過(guò)該項(xiàng)分析可以找出在統(tǒng)計(jì)上顯著富集的.該功能或者定位有可能與研究的目前有關(guān)。

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