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蛋白質(zhì)組學(xué)分析(Proteomic analysis)
作者:admin    發(fā)表時(shí)間:2015-09-23
            蛋白質(zhì)組學(xué)分析(Proteomic analysis)


       提供世界一流的高靈敏度、高可靠性的Nano-LC-ESI-MS/MS蛋白質(zhì)分析鑒定技術(shù)。自2003年以來, 我們向世界各地的尖端科學(xué)研究機(jī)構(gòu)提供了高質(zhì)量的全面的蛋白質(zhì)譜服務(wù)。我們的服務(wù)質(zhì)量也已從我們的國(guó)內(nèi)外客戶在國(guó)際一 流雜志上發(fā)表的論文中得到證實(shí)。

 

Label-free MS定量組學(xué)分析

     1: 由于和代謝或化學(xué)標(biāo)記無關(guān),這個(gè)方法可用于任何蛋白質(zhì)樣品,包括原代細(xì)胞樣品,組織和血液樣品。   

     2:該方法結(jié)合三種水平的MS豐度特征(peptide count, spectral count and fragment-ion intensit)來消除重復(fù)的MS測(cè)量值之間的差異。它能夠在相同或者不同樣品中重復(fù)測(cè)定幾千種蛋白。

      3:根據(jù)研究,該方法可以同時(shí)準(zhǔn)確的檢測(cè)> 80%蛋白。


步驟:


1:根據(jù)樣品信息,我們將蛋白按照分子量、電荷、疏水性等性狀分成多個(gè)組分。常用的分離方法包括SDS-PAGE,SCX等色譜方法。蛋白的分組有利于樣品深度的分析和檢測(cè)到更多蛋白。


2:如果需要進(jìn)行某一類蛋白組學(xué)分析,例如有特定修飾的肽段,我們需要進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)的親和純化,純化過程包括:Trypsin水解和親和層析。通常IMAC方法用于純化磷酸化肽鏈,抗體經(jīng)常用來純化乙酰化或泛素化肽鏈,能夠有針對(duì)性的對(duì)翻譯后修飾的位點(diǎn)進(jìn)行識(shí)別。由于親和純化后未經(jīng)修飾的肽鏈被去除,翻譯后修飾肽鏈的相對(duì)含量能夠測(cè)出。


3:獲得的LCMS數(shù)據(jù)輸入到我們的專有軟件程序中進(jìn)行生物信息學(xué)分析。

分析包括:

        i). 從MS / MS數(shù)據(jù)識(shí)別肽序列;

        ii). 聚集相同的蛋白所有肽序列;

        iii).從多個(gè)組分中聚集相同蛋白;

        iv).計(jì)算每個(gè)蛋白質(zhì)的SNI和在原樣品中的相對(duì)豐度;

        v).對(duì)于在進(jìn)行比較的的幾組樣品中,如果有些蛋白的差異高于設(shè)置的標(biāo)準(zhǔn),會(huì)對(duì)其進(jìn)行差異分析來鑒別這些蛋白種類。


優(yōu)勢(shì):

1:ProtTech 十二年質(zhì)譜檢測(cè)經(jīng)驗(yàn),品質(zhì)保證;

2:優(yōu)化了樣品處理步驟,最大程度保證蛋白信息的完整性;

3:專有的系統(tǒng)改進(jìn)技術(shù)增加蛋白檢測(cè)的數(shù)量,提高了檢測(cè)的靈敏度。

4:ProTtech已開發(fā)了十幾種專有的分析軟件,已確保檢測(cè)結(jié)果的準(zhǔn)確。



相關(guān)文獻(xiàn):

The molecular mechanism of mediation of adsorbed serum proteins to endothelial cells adhesion and growth on biomaterials

D Yang, X Lü, Y Hong, T Xi, D Zhang - Biomaterials, 2013 - Elsevier

... the aim of this study is to systematic investigate the molecular mechanism of mediation ... Protein
samples were desalted by dialysis using membrane with a molecular weight cut off ... by
NanoLC-MS/MS peptide sequencing technology were performed in ProtTech, Inc., (Norristown ...

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